Алексей Хрущёв писал(а): ↑Пн ноя 30, 2020 11:35 am
Нет, в моем случае должно быть совсем другое. Во-первых, "лигандом" является не ион металла, а большая органическая молекула под 500 Да. Во-вторых, сэндвич в моем случае точно не получится - стерические ограничения просто не позволят им разместиться перпендикулярно полости, как это бывает у краун-комплексов с металлами, молекулы гостя могут только "облепить" циклодекстрин по краям, параллельно полости.
В контексте того, что я написал выше, это как раз тот случай, т.е. "бочком". Иными словами, такое взаимодействие имеет тенденцию быть менее чётко геометрически определённым. В случае иона металла и крауна ситуация ещё вполне благополучная, из-за того, что ион металла сферически симметричен. Однако если есть две больших молекулы, то там вариантов образования пары в общем случае гораздо больше. Впрочем, если есть определённая комплементарность, и возможно ожидать какой-то определённой предпочтительной геометрии, то кристаллы растить однозначно стоит. А если нет - то взаимодействие достаточно неспецифично, то в общем случае с этим не стоит возиться даже в растворе (исключение составляют очень большие молекулы, типа какой-нибудь пары белок-антитело, где кристаллизовать такой агрегат всегда крайне сложно, если вообще возможно).