TD DFT

вопросы строения молекул и квантовой химии
Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Сб дек 20, 2014 4:25 pm

Чек делал, писал что нужно 320 mw.

[ Post made via iPhone ] Изображение

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: TD DFT

Сообщение Гесс » Сб дек 20, 2014 6:27 pm

угу, мне тоже кажется что это не программное падение а чего то нехватило или случилось.
Что гамес обычно делает после сконвержившегося тддфт?

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Сб дек 20, 2014 6:36 pm

Гесс, это моя первые попытки td dft, поэтому я не могу ответить на вопрос!

Аватара пользователя
amge
Сообщения: 2050
Зарегистрирован: Вт июл 31, 2007 11:42 am

Re: TD DFT

Сообщение amge » Сб дек 20, 2014 7:11 pm

AlexKsen писал(а):Чек делал, писал что нужно 320 mw.
В тех случаях, о которых я говорил, чек тоже был сделан, и показывал намного меньше, чем гамесс реально отжирал. Подозреваю, что чеку можно верить только когда на 1 ядре пускаете. Посмотрите, что на нодах происходит. Может, и не в памяти дело...

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: TD DFT

Сообщение Гесс » Сб дек 20, 2014 7:28 pm

Дык посчитайте молекулу метана - узнаем что там гамес делает.

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Сб дек 20, 2014 7:37 pm

Давайте попробуем:) Как только посчитаю, выложу что получится!

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Пн дек 22, 2014 10:07 pm

А вот и метан! Только странно, почему то не захотел с симметрией Td считать. Пришлось С1. Вроде расчет прошел нормально, а самое главное, очень быстро! Может дело в базисе?!
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Ср дек 31, 2014 4:59 pm

Уважаемые форумчане, всех с наступающим Новым Годом:)
А теперь вопрос: попробовал комплекс Ni запустить, а там даже близко к TD расчету не подошло. Посмотрите и подскажите, что не так, пожалуйста! Спасибо!
https://cloud.mail.ru/public/30373e614296/NITDDFT.out

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: TD DFT

Сообщение Гесс » Ср дек 31, 2014 5:58 pm

строка 812206 - SCF DID NOT CONVERGE...NO TDDFT=EXCITE CALCULATION

У вас 30 итераций для сведения scf (строка 2601, 2774), оно не свелось (строка 2834), следующие 800 тысяч строк - бесполезная трата времени.

Увеличьте число итераций для scf (ничего не гарантирует, но глядя на то как оно сводилось - скорее всего поможет), понизьте критерий сходимости (нерекомендованный метод), поиграйте с vshift (не разбираюсь), используйте продвинутые методы сведения (в gaussian qc, xqc, в гамесе понятия не имею).

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Ср дек 31, 2014 7:49 pm

Гесс, спасибо:) Попробую MAXIT увеличить до 60!

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Пт янв 02, 2015 6:31 pm

После увеличения числа итераций, расчет шел дольше предыдушего, но все равно слетел с непонятной ошибкой:(
https://cloud.mail.ru/public/30373e614296/NITDDFT.out

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: TD DFT

Сообщение Гесс » Пт янв 02, 2015 8:11 pm

AlexKsen писал(а):расчет шел дольше предыдушего,
А именно:
Line 2662: TOTAL WALL CLOCK TIME= 2.3 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 46.55%
Line 2669: TOTAL WALL CLOCK TIME= 3.3 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 60.60%
Line 2744: TOTAL WALL CLOCK TIME= 63.6 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 93.50%
Line 2767: TOTAL WALL CLOCK TIME= 63.7 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 93.40%
Line 2869: TIME TO FORM FOCK OPERATORS= 3705.0 SECONDS ( 61.7 SEC/ITER)
Line 2871: TIME TO SOLVE SCF EQUATIONS= 1034.4 SECONDS ( 17.2 SEC/ITER)
Line 793067: TOTAL WALL CLOCK TIME= 5016.2 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 97.04%
Line 812238: TOTAL WALL CLOCK TIME= 5035.0 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 96.94%
Line 812244: TOTAL WALL CLOCK TIME= 5035.4 SECONDS, CPU UTILIZATION IS 96.93%
То есть сцф не свелось за чуть меньше полутора часов, а потом 4 часа страдало фигней.
Последний раз редактировалось Гесс Пт янв 02, 2015 8:26 pm, всего редактировалось 1 раз.

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Пт янв 02, 2015 8:16 pm

Ок, попробую:)

[ Post made via iPhone ] Изображение

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: TD DFT

Сообщение Гесс » Пт янв 02, 2015 8:28 pm

Время на одну сцф итерацию 17 секунд - так что 100 итераций удлинят ваш расчет на меньше 20 минут до получения интересующего ответа, как там события будут развиваться дальше - фиг его знает.

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Вс янв 04, 2015 8:42 am

Вот и долгожданный out, но слетевший:(
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: TD DFT

Сообщение Гесс » Вс янв 04, 2015 3:53 pm

AlexKsen писал(а):Вот и долгожданный out, но слетевший:(
Вы приложили нормально закончившийся гауссиановский аутпут синглпоинтногорасчета молекулы воды длившийся 1 секунду.

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Вс янв 04, 2015 6:41 pm

Голова, два уха:) Прошу прощения, перепутал файлы!
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.

Аватара пользователя
Гесс
Сообщения: 13067
Зарегистрирован: Ср фев 15, 2012 11:19 pm

Re: TD DFT

Сообщение Гесс » Вс янв 04, 2015 6:56 pm

Померло посреди сцф процедуры которую раньше спокойно проходило (неудачно но проходило).
Если в инпуте ничего не менялось кроме числа итераций то это какая то внешняя причина - перезапустите.
Кстати глядя в первые строки - аутпута (стр 71-72) - оно само пребрасывает на вторую строку или это вы его искуственно перенесли (я понятия не имею имеет ли такой синтаксис какое то влияние в гамессе).

P.S. Мультиплетность 5? Серьезно? Оно реально в квадруплете ниже чем в более низкоспиновых состояниях? Мы это где то уже не обсуждали?

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Вс янв 04, 2015 7:14 pm

Да, это я перенес, но ни каких проблем не должно быть. Перезапущу еще разок! Да, про мультиплетность обсуждали, когда у меня Ni и Cu оптимизироваться не хотели, а с 5 Ni полетел.

Аватара пользователя
AlexKsen
Сообщения: 602
Зарегистрирован: Пн мар 07, 2011 8:43 am

Re: TD DFT

Сообщение AlexKsen » Сб янв 17, 2015 10:46 am

Спасибо, всем за помощь. Все удалось:) А теперь еще один вопрос: как визуализировать выдачу tddft pc gamess. Гаусиановскую можно и в кемкрафте и в гаусвью. Понятно, что просто в ориджине можно, но просто для интереса ка? Я, конечно, для интереса в гаусиановскую выдачу поставил свои энергии и энергию осциллятора:)

Ответить

Вернуться в «квантовая химия и моделирование»